2024/06/25

分著情報:マテリアルズデザイン関連分野における
ケモメトリクス適用に関する湯田の分著情報です。

 著書名:

マテリアルズ・インフォマティクスによる材料開発と活用集
株式会社技術情報協会 (発刊年 2022年)
ISBN978-4-86104-732-9  C3043

湯田 担当部分
第10章、第5節 
インシリコ(In Silico)でのケモメトリックス・人工知能による化学物質の毒性(安全性)評価



  ケモメトリックスの適用分野として、最近展開されてきているのが「マテリアルズ」関連の研究、開発分野です。本分野は伝統的に、分子シミュレーションや三元図等の手法が適用されてきました。これらの解析手法に継ぐ三番目の手法としてケモメトリクス(化合物情報を用いない場合はデータサイエンス)の技術の適用事例が多くなりつつあります。
 
 本著は、マテリアルズインフォマティクスという著書名の通り、マテリアルズデザインというよりは、より情報に近い立場での解説、討論となります。しかし、手法の問題は当然マテリアルデザイン研究への適用を含んでおります。この点で、ケモメトリックスの技術は先に紹介した毒性予測・評価と同様に極めて重要です。マテリアルデザイン関連研究者の方々によるケモメトリックスの適用のご参考になれば幸いと存じます。








 




2024/06/22

分著情報【目次です】:
化学物質の毒性評価手法とその事例

  以下が、ケモインフォマティクス関連著書(「化学物質の毒性評価手法とその事例」)の中で、湯田が分筆した部分の目次です。 ケモメトリクスの毒性評価関連研究への適用に関する様々な事項が著述されています。ご参考ください。

1節 ケモインフォマティクスを用いた化合物毒性予測での記述子設計とデータ解析

 1.ケモメトリックス研究に用いる化合物の吟味

  1.1 サンプル化合物及びサンプル母集団の吟味

  1.2 サンプル母集団のクラスポピュレーションでの留意点

 2.化合物より創出された記述子の調整と記述子選択

  2.1 創出された記述子の吟味とウオッシング(洗浄):簡易的な記述子選択

  2.2 高度な記述子選択とノイズサンプル化合物の取り出し

  2.3 最終選択記述子の種類と適用パターン

 3.芳香族アミン化合物の発がん性に関する解析

  3.1 ケモメトリックスによる解析に用いたサンプルデータと要因解析実施目的

  3.2 記述子創出から記述子洗浄および簡易な記述子選択実施

  3.3 ケモメトリックス解析に重要な役割を果たす記述子の選択

  3.4 重要記述子選択の実施手順

  3.5 重要記述子選択の実施結果

  3.6 重要記述子による要因解析の実施

  3.7 ニクラス分類/予測結果

 4.まとめ

  4.1 化学分野のデータサイエンスの(ケモメトリックス)適用時の留意点

  4.2 毒性関連研究分野のメカニズム追及への展開

  4.3 メカニズム解析におけるケモメトリックス研究の役割と留意点

  4.4 今後から近未来への展開:データサイエンスの自動化から自律化への進歩





2024/06/06

分著情報:
化学物質の毒性評価手法とその事例

   本ブログではデータサイエンスが基本技術となり、これを基本として来るべく「情報時代」における「自律型研究」への適用等に関する討論を行います。当然ながら「情報時代」の革命技術は「(大規模)生成AI」であるので、全体的な構成としては、データサイエンス技術や手法を基本とし、これと(大規模)生成AI技術を融合を目指します。最終的には「コンピュータ時代」のコンピュータ支援による単純データ解析から、様々な知識や創造性、種々の判断、決定等を伴う「自律型研究」の展開や発展を目指します。

 本論の討論の前に、湯田が昨年に著述した内容が参考資料、及びケモインフォマティクスの参照になればと考えますので、紹介いたします。本投稿にあるように、全体としてケモインフォマティクス(化学情報学)がテーマの書籍となっております。この中で、化学物質の毒性評価に適用されているケモメトリクス(化学計量学)関連技術に関して分著しました。


 著書名:ケモインフォマティクスにおけるデータ収集の最適化と解析手法

     発刊日; 2023年4月28日 技術情報協会

 湯田分著部分;

   第7章 化学物質の毒性評価手法とその事例

 内容は、タイトルにあるように毒性評価に適用されるケモメトリクス関連手法の適用に関する解説となっております。毒性評価分野では昔から予測や分類、要因解析という観点でケモメトリクス手法の適用が推進されてきました。特に国際的に決められたICH M7では、インシリコ技術による毒性予測を積極的に取り入れるという観点で対応されております。

 ICH M7ではインシリコ手法としてケモメトリクス的手法と人工知能による手法の両方の活用が推奨されております。この意味でも、毒性評価は現在から今後の「情報時代」における発展が期待される状況となっています。

 湯田が分著した本稿は、ケモメトリクスを実施する観点での様々な留意事項について細かく解説しているので、今後毒性評価にケモメトリクスを適用されようとする研究者の方々には是非読んでいただきたい著書となります。著書の内容がわかる目次は次の投稿にて列挙致しますので、ご期待ください。